En ocasiones, las pruebas de imagen permiten observar una estrechez en la vía biliar, pero sin permitir diferenciar si se trata de una estrechez 2º a una causa benigna (por ejemplo una zona cicatricial 2º a una colangitis) o maligna (como un colangiocarcinoma o tumor de la vía biliar). Durante la CPRE, la colangiografía (inyección de contraste en la vía biliar) nos permite diferenciar este tipo de lesiones, pero en otras ocasiones ese diferencia no queda clara.
Una vez realizada una CPRE, cuando se ha cortado la papila mayor (puerta que une la vía biliar con el duodeno), es posible, no sólo introducir un catéter, sino también otro tipo de instrumental. El spyglass es un tubo ultrafino, que se introduce por el canal de trabajo del endoscopio (pequeño conducto interior del tubo, por donde se introduce el material) y permite realizar una coledocoscopia (visualización directa de vía biliar). Esta técnica permite tanto la visualización de la vía biliar, como la toma de biopsias de las lesiones que se observan durante la exploración.